De conformidad con el artículo tercero de los Estatutos de la Fundación Alianza Estratégica, su naturaleza y fines son: “Artículo 3.- La Fundación se establece para promover y desarrollar la formulación, ejecución, evaluación y seguimiento de proyectos educativos; tecnológicos; de investigación científica; de asistencia y cooperación técnica; jurídicos; pedagógicos; de consultoría; de gestión y control; académicos; de capacitación; y, de fortalecimiento y desarrollo institucional.

Por lo tanto, los fines y objetivos de la Fundación son los siguientes:

Artículo 4.- La Fundación se mantendrá independiente ante asuntos de carácter político partidista y religioso.”